У 2017 році Ельдар Кантемиров вийшов на одиночний пікет з плакатом «Кримські татари — не терористи», протестуючи проти утисків кримських татар за національною і релігійною ознакою. Був затриманий і притягнутий до адміністративної відповідальності — штрафу в розмірі 10 000 рублів — за «порушення встановленого порядку пікетування» (ч. 5 ст. 20.2 Кодексу про адміністративні правопорушення РФ).

У листопаді 2017 року вдома в Ельдара Кантемирова пройшов перший обшук. До обшуку були залучені ОМОН і спецсили. У Кантемирова була вилучена вся електронна техніка, але жодних обвинувачень йому висунуто не було.

Однак Ельдар Кантемиров не припинив свою громадську діяльність. Він почав організовувати дитячі свята в Алуштинському і Сімферопольському регіонах. Останнє свято провів безпосередньо за день до свого затримання — 8 червня 2019 року, в селі Кутузівка міста Алушта. Кантемирову надходили погрози з боку прокуратури та адміністрації міста Алушта, у зв'язку з тим, що свято не узгоджений з муфтіятом Криму.

У червні 2019 року, співробітники ФСБ затримали голову громади «Алушта» Ленура Халілова за звинуваченням в організації діяльності терористичної організації. Разом із ним у СІЗО опинилися охоронець мечеті Руслан Месутов, імам мечеті села Малоріченське Руслан Нагаєв і викладач арабської мови Ельдар Кантемиров. Двох останніх звинуватили в участі в діяльності терористичної організації. До цих звинувачень додалося ще одне — спроба насильницького захоплення влади.

10 червня 2019 року в Криму пройшло 8 обшуків в Алуштинському і Білогірському районах Криму, в результаті яких були арештовані 8 кримських татар, серед яких був Ельдар Кантемиров. Всіх їх підозрюють у членстві в забороненій в Росії політичної організації Хізб ут-Тахрір.
‍

Вже після взяття під варту, під час стаціонарного обстеження Кантемирова в психіатричній лікарні, у нього виявили першу стадію хвороби Паркінсона. Його адвокат, Айдер Азаматов, стверджує, що Ельдар потребує регулярного нагляду для запобігання розвитку хвороби. Адвокат також повідомив, що в умовах СІЗО у Кантемирова загострилася хвороба нирок.

Айдер Азаматов стверджує, що кримінальне переслідування Кантемирова політично мотивоване: «Ельдар активно відвідував суди, допомагав сім'ям політв'язнів. Наскільки я знаю, виходив з одиночним пікетом проти переслідування кримських татар і був оштрафований. Можна сказати, він став неугодним. Сьогоднішні реалії Криму такі, що з цих людей роблять псевдотерористів».

‍16 серпня Південний окружний військовий суд засудив Ельдара Кантемирова до 13 років. Йому доведеться провести перші два роки покарання у в’язниці — у найсуворішому режимі, а решту часу — у колонії суворого режиму. Після звільнення його чекає півтора року обмеження волі.

‍

‍